В Многопрофильном стационаре НИКИ детства, который находится в городе Мытищи оказывается помощь в 12 отделениях и диагностических подразделений.
Специализированное лечение пациентов проводится по следующим направлениям:
Отделение аллергологии и иммунологии для детей;
Отделение медицинской реабилитации;
Детское кардиологическое отделение;
Отделение анестезиологии и реаниматологии;
Отделение детской эндокринологии;
Отделение детской ревматологии;
Педиатрическое отделение;
Дневной стационар;
Приемно-диагностическое отделение;
Клинико-диагностическая лаборатория;
Кабинет стоматологии;
Отделение реабилитации.