Совет молодых ученых является постоянно действующим коллегиальным совещательным органом, который объединяет клинических ординаторов, аспирантов, молодых специалистов и научных сотрудников.

Основные цели Совета молодых ученых направлены на:

• создание условий для развития научно-исследовательской деятельности, содействие профессиональному росту и реализации научного потенциала молодёжи Института;
• развитие инновационной и общественной деятельности молодых ученых;
• обмен опытом и знаниями между молодыми сотрудниками других институтов в рамках консорциума «5П детская медицина», Международное сотрудничество;
• пропаганда научных знаний среди молодежи.