Отделение было открыто в феврале 2018 года для детей с заболеваниями органов пищеварения. Сегодня это единственное специализированное отделение в Московской области, располагающее гастроэнтерологическими койками для детей.
Арсенал института включает полный спектр эндоскопических исследований верхних и нижних отделов желудочно-кишечного тракта, позволяющих выявлять патологии на ранних стадиях. Врачи применяют рентгенологические исследования, экспертное УЗИ органов брюшной полости с допплерографией и фиброэластометрию печени. Для сложной диагностики используются КТ и МРТ с контрастированием. Лабораторная база Института позволяет проводить генетические, иммунологические и биохимические анализы, включая определение фекального кальпротектина, панкреатической эластазы, а также экспресс-тесты на содержание аммиака в крови для профилактики печеночной энцефалопатии.
Мультидисциплинарный подход является основой работы Института: при необходимости пациент получает консультацию кардиолога, невролога, ревматолога, дерматолога, эндокринолога и др. Еженедельно в отделении проводится профессорский обход, который осуществляет главный внештатный специалист детский гастроэнтеролог Минздрава Московской области, к.м.н. Екатерина Александровна Яблокова.
На базе отделения действует Центр детской гастроэнтерологии — здесь оказывается помощь при редких (орфанных) заболеваниях, включая выявление и диагностику целиакии, а также Центр воспалительных заболеваний кишечника, где детям с такими тяжелыми патологиями, как болезнь Крона и язвенный колит, оказывается высокотехнологичная помощь с применением генно-инженерных биологических препаратов.